Protein–RNA interactions for Protein: J3QM38

Zfp994, Zinc finger protein 994, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp994J3QM38 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zfp994J3QM38 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zfp994J3QM38 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zfp994J3QM38 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zfp994J3QM38 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zfp994J3QM38 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp994J3QM38 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp994J3QM38 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp994J3QM38 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp994J3QM38 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp994J3QM38 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp994J3QM38 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp994J3QM38 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp994J3QM38 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp994J3QM38 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp994J3QM38 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp994J3QM38 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp994J3QM38 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp994J3QM38 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp994J3QM38 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp994J3QM38 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp994J3QM38 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp994J3QM38 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp994J3QM38 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp994J3QM38 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp994J3QM38 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp994J3QM38 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp994J3QM38 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp994J3QM38 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp994J3QM38 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp994J3QM38 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp994J3QM38 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp994J3QM38 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp994J3QM38 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp994J3QM38 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp994J3QM38 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp994J3QM38 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp994J3QM38 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp994J3QM38 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp994J3QM38 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp994J3QM38 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp994J3QM38 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms