Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20830J3KML6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms