Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm29394H3BIW7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm29394H3BIW7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms