Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r67G5E8C1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms