Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcf11G3X9Z4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pcf11G3X9Z4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcf11G3X9Z4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms