Protein–RNA interactions for Protein: G3UW60

Susd5, MCG14773, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd5G3UW60 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Susd5G3UW60 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd5G3UW60 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms