Protein–RNA interactions for Protein: F7BE40

Arl9, ADP-ribosylation factor-like 9 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl9F7BE40 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arl9F7BE40 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arl9F7BE40 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arl9F7BE40 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arl9F7BE40 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arl9F7BE40 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arl9F7BE40 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arl9F7BE40 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arl9F7BE40 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arl9F7BE40 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arl9F7BE40 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arl9F7BE40 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arl9F7BE40 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arl9F7BE40 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arl9F7BE40 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arl9F7BE40 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arl9F7BE40 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arl9F7BE40 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arl9F7BE40 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arl9F7BE40 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arl9F7BE40 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arl9F7BE40 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arl9F7BE40 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Arl9F7BE40 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arl9F7BE40 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arl9F7BE40 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Arl9F7BE40 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms