Protein–RNA interactions for Protein: F6XGJ4

Gm17093, Predicted gene 17093 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17093F6XGJ4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gm17093F6XGJ4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17093F6XGJ4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms