Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rdh16f1E9Q9P8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rdh16f1E9Q9P8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms