Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8Q6

Ccdc141, Coiled-coil domain-containing 141, mousemouse

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc141E9Q8Q6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc141E9Q8Q6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc141E9Q8Q6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms