Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
6030445D17RikE9Q8F9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms