Protein–RNA interactions for Protein: E9Q623

BC051665, cDNA sequence BC051665, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051665E9Q623 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BC051665E9Q623 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BC051665E9Q623 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BC051665E9Q623 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BC051665E9Q623 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
BC051665E9Q623 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC051665E9Q623 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC051665E9Q623 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC051665E9Q623 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC051665E9Q623 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC051665E9Q623 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC051665E9Q623 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC051665E9Q623 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC051665E9Q623 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BC051665E9Q623 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC051665E9Q623 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC051665E9Q623 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC051665E9Q623 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC051665E9Q623 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC051665E9Q623 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC051665E9Q623 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC051665E9Q623 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC051665E9Q623 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BC051665E9Q623 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms