Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K2

Gm17728, Predicted gene, 17728, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17728E9Q5K2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm17728E9Q5K2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms