Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BC005561E9Q5E2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC25■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC25■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BC005561E9Q5E2 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms