Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r238E9Q373 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r238E9Q373 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r238E9Q373 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r238E9Q373 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r238E9Q373 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r238E9Q373 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r238E9Q373 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r238E9Q373 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r238E9Q373 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r238E9Q373 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r238E9Q373 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r238E9Q373 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r238E9Q373 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r238E9Q373 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r238E9Q373 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r238E9Q373 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r238E9Q373 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r238E9Q373 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r238E9Q373 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r238E9Q373 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r238E9Q373 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r238E9Q373 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r238E9Q373 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r238E9Q373 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r238E9Q373 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r238E9Q373 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r238E9Q373 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r238E9Q373 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r238E9Q373 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r238E9Q373 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r238E9Q373 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r238E9Q373 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r238E9Q373 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r238E9Q373 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r238E9Q373 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r238E9Q373 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r238E9Q373 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r238E9Q373 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r238E9Q373 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r238E9Q373 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r238E9Q373 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r238E9Q373 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r238E9Q373 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r238E9Q373 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r238E9Q373 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r238E9Q373 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r238E9Q373 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms