Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430401F13RikE9Q328 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms