Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1X6

6430550D23Rik, RIKEN cDNA 6430550D23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430550D23RikE9Q1X6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
6430550D23RikE9Q1X6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms