Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
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