Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdr1E9Q0B4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms