Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm20425E9Q035 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms