Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddx60E9PZQ1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Ddx60E9PZQ1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx60E9PZQ1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms