Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ryr1E9PZQ0 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.7 ms