Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc144bE9PVZ3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms