Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc62E9PVD1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms