Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttc17E9PVB5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttc17E9PVB5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms