Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FgaE9PV24 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms