Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Syde2E9PUP1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms