Protein–RNA interactions for Protein: E2JF22

Piezo1, Piezo-type mechanosensitive ion channel component 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Piezo1E2JF22 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Piezo1E2JF22 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Piezo1E2JF22 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Piezo1E2JF22 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Piezo1E2JF22 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Piezo1E2JF22 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Piezo1E2JF22 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Piezo1E2JF22 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Piezo1E2JF22 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Piezo1E2JF22 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Piezo1E2JF22 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Piezo1E2JF22 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Piezo1E2JF22 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Piezo1E2JF22 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Piezo1E2JF22 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Piezo1E2JF22 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Piezo1E2JF22 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Piezo1E2JF22 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Piezo1E2JF22 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Piezo1E2JF22 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Piezo1E2JF22 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Piezo1E2JF22 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Piezo1E2JF22 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Piezo1E2JF22 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms