Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cngb1E1AZ71 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC27.57■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Cngb1E1AZ71 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms