Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6R0

Gm5478, Predicted pseudogene 5478, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5478D3Z6R0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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