Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Vpreb3D3Z6J4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms