Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim12cD3Z3L3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim12cD3Z3L3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim12cD3Z3L3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim12cD3Z3L3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim12cD3Z3L3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim12cD3Z3L3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim12cD3Z3L3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim12cD3Z3L3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim12cD3Z3L3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim12cD3Z3L3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms