Protein–RNA interactions for Protein: D3Z257

Gm5930, Predicted gene 5930, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5930D3Z257 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5930D3Z257 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms