Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Gm3543D3Z235 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3543D3Z235 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Gm3543D3Z235 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3543D3Z235 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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