Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kif28pD3YXS5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kif28pD3YXS5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms