Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SafbD3YXK2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SafbD3YXK2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SafbD3YXK2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SafbD3YXK2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SafbD3YXK2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SafbD3YXK2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms