Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ptprz1B9EKR1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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