Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nxpe3B9EKK6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nxpe3B9EKK6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nxpe3B9EKK6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nxpe3B9EKK6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nxpe3B9EKK6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nxpe3B9EKK6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nxpe3B9EKK6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nxpe3B9EKK6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nxpe3B9EKK6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nxpe3B9EKK6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nxpe3B9EKK6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nxpe3B9EKK6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nxpe3B9EKK6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nxpe3B9EKK6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nxpe3B9EKK6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nxpe3B9EKK6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nxpe3B9EKK6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nxpe3B9EKK6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nxpe3B9EKK6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nxpe3B9EKK6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nxpe3B9EKK6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nxpe3B9EKK6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nxpe3B9EKK6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nxpe3B9EKK6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nxpe3B9EKK6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nxpe3B9EKK6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nxpe3B9EKK6 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nxpe3B9EKK6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nxpe3B9EKK6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms