Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cttnbp2B9EJA2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.56■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms