Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Clip3B9EHT4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clip3B9EHT4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms