Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

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Length 1,276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gm20547B8JJN0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gm20547B8JJN0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gm20547B8JJN0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Gm20547B8JJN0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Gm20547B8JJN0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Gm20547B8JJN0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Gm20547B8JJN0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Gm20547B8JJN0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Gm20547B8JJN0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Gm20547B8JJN0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Gm20547B8JJN0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20547B8JJN0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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