Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC6

Polr3a, DNA-directed RNA polymerase subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3aB2RXC6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr3aB2RXC6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Polr3aB2RXC6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr3aB2RXC6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr3aB2RXC6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr3aB2RXC6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr3aB2RXC6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr3aB2RXC6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr3aB2RXC6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr3aB2RXC6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr3aB2RXC6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr3aB2RXC6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr3aB2RXC6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr3aB2RXC6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr3aB2RXC6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr3aB2RXC6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms