Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clrn2B2RVW2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clrn2B2RVW2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clrn2B2RVW2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clrn2B2RVW2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clrn2B2RVW2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Clrn2B2RVW2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clrn2B2RVW2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clrn2B2RVW2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clrn2B2RVW2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clrn2B2RVW2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clrn2B2RVW2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Clrn2B2RVW2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clrn2B2RVW2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clrn2B2RVW2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clrn2B2RVW2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clrn2B2RVW2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clrn2B2RVW2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clrn2B2RVW2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clrn2B2RVW2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clrn2B2RVW2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clrn2B2RVW2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clrn2B2RVW2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clrn2B2RVW2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clrn2B2RVW2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clrn2B2RVW2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clrn2B2RVW2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clrn2B2RVW2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clrn2B2RVW2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clrn2B2RVW2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clrn2B2RVW2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clrn2B2RVW2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clrn2B2RVW2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms