Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud7bB2RUR8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud7bB2RUR8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud7bB2RUR8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud7bB2RUR8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud7bB2RUR8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud7bB2RUR8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud7bB2RUR8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud7bB2RUR8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud7bB2RUR8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud7bB2RUR8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud7bB2RUR8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud7bB2RUR8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud7bB2RUR8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud7bB2RUR8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud7bB2RUR8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud7bB2RUR8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud7bB2RUR8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud7bB2RUR8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud7bB2RUR8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud7bB2RUR8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud7bB2RUR8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud7bB2RUR8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud7bB2RUR8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud7bB2RUR8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud7bB2RUR8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud7bB2RUR8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud7bB2RUR8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms