Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usf3B2RUQ2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms