Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms