Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc22a28B2RT89 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc22a28B2RT89 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms