Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf3B2RQG2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms