Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Uhrf1bp1B2KF50 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms