Protein–RNA interactions for Protein: B1AUC4

Ube2u, Ubiquitin-conjugating enzyme E2U (putative), mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2uB1AUC4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ube2uB1AUC4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ube2uB1AUC4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ube2uB1AUC4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ube2uB1AUC4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ube2uB1AUC4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ube2uB1AUC4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ube2uB1AUC4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ube2uB1AUC4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ube2uB1AUC4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ube2uB1AUC4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ube2uB1AUC4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ube2uB1AUC4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ube2uB1AUC4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ube2uB1AUC4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ube2uB1AUC4 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ube2uB1AUC4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ube2uB1AUC4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ube2uB1AUC4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ube2uB1AUC4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ube2uB1AUC4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ube2uB1AUC4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ube2uB1AUC4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ube2uB1AUC4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ube2uB1AUC4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ube2uB1AUC4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms